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2000年，“WBZ－500型微机变压器保护装置”获得国家科技进步二等奖。

1999年，“强功率交、直流电能在线综合测试技术”获得国家科技进步二等奖。

1998年，学院成立研究生工作组。

1998年12月，应用电子技术专业由交通学院划并入电力工程系。

1998年9月，潘垣院士调入华中理工大学电力工程系工作。

1998年3月，重新组建电力工程系，原电力工程系的水电机械专业并入能源与动力工程学院，并以原电力工程系的水电站自动化专业为基础，成立了水电及数字化工程学院。

1998年2月，能源学院成立电力工程系和动力工程系，撤销能源学院党总支，成立电力工程系党总支和动力系党总支；聘张勇传任能源学院院长，黄素逸、程时杰、尹项根、刘伟任副院长；尹项根任电力工程系系主任，周海云人电力工程系常务副主任，邹积岩、孙亲锡、辜承林任副主任，张国德人电力工程系党总支书记。

1997年，电机与电器专业通过评审，成为国家重点学科。

1997年，电力系张勇传教授当选为中国工程院院士。

1997年1月，成立能源科学与工程学院党总支，撤销电力工程系、电力工程系党总支、动力工程系、动力工程系党总支。

1996年12月，电力工程系与动力工程系合并组建能源工程学院。

1996年，获得全国首批一级学科博士学位授予权。