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同济药学院李华教授、沈阳药科大学无涯学院陈丽霞教授、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心李行舟研究员等组成联合攻关小组,就目前武汉爆发的新型冠状病毒(2019-nCoV,简称新冠病毒)肺炎疫情,开展了抗新冠病毒潜在药物的筛选研究工作。
利用药物重定位策略,在已有药物中寻找对抗新冠病毒的治疗药物是对抗疫情的有效手段和当务之急。研究表明,冠状病毒nsp3编码的木瓜样蛋白酶(papain-like protease,PLP)在病毒基因组复制及逃避宿主抗病毒天然免疫中发挥重要作用,是药物开发的良好靶点。PLP不仅具有蛋白水解酶活性,同样具有去泛素化酶(DUB)活性,PLP利用其蛋白水解酶活性及DUB活性通过一系列的分子机制逃避宿主抗病毒免疫反应,抑制干扰素表达;它是除了冠状病毒3CL水解酶之外,另一个冠状病毒感染人类所必需的重要蛋白。
图为潜在的抑制剂与新冠病毒PLP结合示意图。
为了找到抑制新型冠状病毒的潜在药物,攻关小组从日前公布的新冠病毒蛋白序列中找出了新冠病毒PLP的序列,发现它和SARS病毒的PLP具有82%的氨基酸同源性。研究组采用同源建模的方法模拟了新冠病毒PLP的蛋白质结构,明确了它的药物结合口袋,运用基于蛋白质结构的计算机虚拟筛选方法,从ZINC已成药化合物库(FDA批准药物分子库,2924个小分子化合物)、自己实验室建立的中药和天然产物数据库(约1000个化合物)中筛选得到33个新冠病毒PLP的潜在抑制剂(见表1),预期有较好的抗2019-nCoV活性。本研究建议采用老药新用的策略,在对新冠病毒感染肺炎患者的临床治疗中对这些药物给予考虑和关注,也希望有更多团队对这些药物的疗效进行验证。
攻关小组目前正在寻找更多可能抑制新冠病毒的药物靶点,也将继续进行深入的抗新冠病毒活性测试,为后续抗新冠病毒肺炎药物的基础和临床研究提供更多指导信息。
在疫情发生不久后,各个研究团队就火速组成了联合攻关小组,18luck新利电竞
同济药学院博士后郑梦竹、博士生吴灿荣和沈阳药科大学硕士生刘洋等同学牺牲春节休息时间,主动请缨、夜以继日开展研究,和老师们一起完成了本工作。