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转浙江大学“基因组科学”研习班通知

时间:2010-09-08     浏览次数:

 

开 班 时 间:2010年10月30日-11月6日
上 课 内 容:基因组学、蛋白质组学、系统生物学
上机实习内容:
1.基因组数据注释和分析; 2.核苷酸序列分析; 3.蛋白质结构与功能分析; 4.芯片数据的基本处理和分析; 5.蛋白质组学数据分析; 6.系统生物学软件实习-网络结构显示与分析。
    随着众多生物基因组测序项目的完成,生物学数据正在加速度增长。如何科学地分析和注释这些高通量数据,已成为生物学工作者急需学习和解决的问题。
    我们将为您提供学术殿堂,请您参加我们举办的“基因组科学”研习班。这里您将可以听到于军教授(注:于军被《科学美国人》评为2002年度世界科学领袖)亲自主讲的基因组学基础知识和前沿进展。林标扬、杨军教授分别主讲系统生物学和蛋白质组学的研究方法和思路。
    我们也将为您邀请经验丰富的胡松年等教授给您细说SNP、基因芯片、新一代测序等实验技术的关键事项。
    如果您正在从事的研究工作并想进一步提升科学研究水平,不妨来这里倾听浙江大学郑树教授、杨军教授、薛庆中教授分别述说在医学和农学应用中的经验和体会。
    如果您想学习从互联网公共数据库获取数据,处理数据方法、从中挖掘有价值的信息资源,您更应该来参加我们举办的“基因组科学”研习班。我们将为您提供优质服务,每人一台PC机,让您紧随大屏幕演示“跟我学”操作。上机实习课6次,带你进入基因组科学大门,辅导您运用网上的软件和工具,绘制进化树,探讨物种起源;从错综复杂的网络中,梳理分子间的相互作用。6天短暂的学习肯定会让您学有所获。我们还给您提供科学出版社发行的最新教材,便于自学、温故知新、复习巩固。
    凡来参加过学习的学员都夸我们的研习班工作认真负责,给学员们提供了极好的“充电”机会。至今我们已举办30期,每期140人左右,学员遍布全国30余个省市。每次研习班都有近20名教授、研究员参加,更多是硕士生、博士生等年轻学者。他们中有一些带着课题或问题前来交流和联系;也有的通过研习班建立了协作关系,共同申请课题,发表论文,其中不少优秀的研究成果,已在SCI期刊上发表。
不学不会,早学早会。有志或有兴趣学习基因组、蛋白质组、系统生物学科研工作者、高校教师及研究生,热烈欢迎您前来杭州参加“基因组科学”研习班。
一、培训班上课内容
    上课内容涵盖“基因组学->蛋白质组学->系统生物学”的研究方法、技术思路、前沿进展及其在各生物学科中的应用。主要内容如下:
1. 基因组的比较研究、DNA测序技术原理与进展(讲课人:于 军 教授)
2. 基因转录组的测定及分析、大规模测序方法及应用、微生物基因组学(讲课人:胡松年教授)
3. 蛋白质组学和系统生物学导论、应用及数据分析(讲课人:杨军教授等)
4. 基因组学、蛋白质组学、系统生物学在医学、农学中的应用(讲课人:郑树、薛庆中教授)
二、培训班上机内容
    上机实习课采用 “跟我学”方式,学习生物信息学软件使用,每人一台PC机跟着大屏幕一步步学会基因组、蛋白质组学数据分析的基本方法。主要内容如下:
实习一: 基因组数据注释和功能分析
    通过序列比对工具BLAST的学习,了解基因功能注释的原理;介绍多序列联配工具ClustalX及分子进化分析软件MEGA4,掌握系统发生树绘制的基本方法,认识基因复制在进化上的功能。
实习二: 核苷酸序列分析
    学习基因序列分析常用的数据库和软件,包括:基因预测,编码区结构分析,选择性剪切分析,基因启动子预测,基因调控元件预测,密码子偏好性分析等内容。
实习三: 芯片的基本数据处理和分析
    使用TM4软件来实现芯片的数据采集,低质量过滤,标准化处理及聚类等可视化分析;使用GenMAPP软件挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义;介绍NCBI GEO数据库,学习检索和提交芯片数据。
实习四:蛋白质结构与功能分析
    从数据库搜索感兴趣的蛋白质氨基酸序列开始,接着对蛋白质基本理化性质、二级结构、和三维空间结构和序列模体进行分析,预测目标蛋白的生物功能。
实习五: 蛋白质组质谱分析
    使用X!Tandem、Mascot、Sequest等软件鉴定蛋白质质谱数据,将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定蛋白;使用TPP软件包进行统计学分析和优化检索结果练习。
实习六:系统生物学软件实习-----网络结构显示与分析
    利用Cytoscape系统生物学分析软件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子网络系统,并与基因表达等数据整合。
欲知详细课表和培训效果请见纳米技术研究院网页:
二、培训对象
从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生。
三、报名方法
若对本期研习内容有兴趣,请将以下报名表回执发送E-mail到genetrain@zju.edu.cn
或传真至(0571-86971760)。我们会立即回信,并登记在册,待排定课表后发给您详细教学日程表(每节课时间、讲课主题、讲课人等)。待您确认后,发给您报到通知并排定上机号。
五、教材
“DNA和蛋白质序列数据分析工具(第二版)”, 薛庆中等编著,科学出版社出版 2010年4月发行。
 六、其他事项
培训地点:杭州 浙江大学华家池校区
收费标准:注册费为¥2500/人(函注册、上机费2400元, 资料费100元),安排食宿、费用自理。
联 系 人:陈爱华   联系电话:13336100452
传    真:0571-86971760
电子邮件地址:genetrain@zju.edu.cn
浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院
中国科学院北京基因组研究所
2010年9月6日
附一:报名回执
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