江西省疾病预防控制中心是正处级公共卫生事业单位，全省疾病预防控制业务技术指导中心。内设业务科所17个、行政职能科室9个。主要承担疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究等基本职能。中心人员编制300人，现有在编职工256人，其中专业技术人员231人，具有高级职称100人，博士学位5人，硕士学位118人。现有全省学术和技术带头人15人，其中国家级专家1人，省级专家4人。组建了一支68人的青年科研创新攻关团队。
中心拥有全国唯一的食品安全风险监测沙门氏菌参比实验室，脊灰、麻疹WHO网络实验室，国家致病菌识别网ChinaNet区域中心实验室，全国首批新冠病毒检测资质实验室，还有流感、艾滋病、乙脑、疟疾省级参比实验室，省食源性疾病诊断溯源重点实验室。中心积极开展疾病预防控制的应用研究，近3年来，首次实现03专项及5G项目科研突破，5项科研成果获省级科技进步奖；承担了20项国家、省部级科研课题；发表论文260余篇，其中SCI论文30余篇；获省级医学领先学科7个，省市共建医学领先学科5个，省县共建医学领先学科3个。多次被国家四部委授予先进集体，2020年获中共中央、国务院、中央军委表彰的全国抗击新冠肺炎疫情先进集体。